公元299年底,贾南风因自己无子,深恐大权旁落于他人之手,加之太子司马遹与贾南风亲信贾谧素有隙,贾南风遂趁太子司马遹酒醉,令其抄写大逆之言,诬陷太子司马遹欲杀司马衷与贾南风,想趁机杀他。因遭大臣张华、裴頠的反对,贾南风退而求其次,免太子司马遹为庶人,不久将其幽禁于许昌。
公元300年,晋宗室赵王司马伦与其谋臣孙秀图谋篡位,忌贾南风心狠手辣,又惧司马遹聪明刚猛,遂先巧施离间计,以图借刀杀人、一箭双雕。孙秀派人四处散布谣言,说有人暗中打算除掉贾南风,拥立司马遹。贾南风闻言即以司马衷的名义派宦官孙虑去许昌毒杀司马遹,因司马遹拒不服毒,孙虑竟用药杵将他槌死。
司马遹一死,宗室诸王更是心怀异志,诸王作乱更甚于前。