公元1410年，明政府扩大漕运规模，由岁运250万石增至300万石，以足国用。为此，明成祖朱棣特令江、浙、湖广三省布政使和都指挥使必须亲自负责督运。为适应漕运规模的扩大，从公元1411年起，又开始大规模整治贯穿南北的大运河之关键地段——会通河。该河北起山东临清州（在今山东），南至江苏淮安府之邳州（在今江苏），全长450多里。洪武年间因河岸冲决，河道淤塞已达三分之一，故只好陆运，沿途设八个递运所，每处用民丁3000人、车200辆接力转输。久之，给人民带来巨大困难。六月，会通河开浚完工。
公元1416年，朱棣在淮安府清河、福兴及徐州府沽头、金钩和山东省谷城、鲁桥诸闸分别置以闸官，加强管理，以确保漕船顺利直达通州。至此，漕运河道全部疏通。疏通漕运后，明朝就停止了海运。
